试玩 23andme 基因检测项目

23andme，google投资的一家基因检测公司，受限于FDA的监管政策，目前除了祖源之外没有提供健康检测的分析解读报告。但是23andme提供了原始的vcf数据文件下载，也就是健康解读报告的原始变异数据。
我们计划做一个基因解读相关的中文社区。基于成本和兴趣的考虑，我准备自己买23andme的检测服务，获取他们的原始数据（国内对外报价基本上都是5k-2w起，包括了一些解读服务）。
v2ex上对基因和健康关系有兴趣的朋友，我们可以一起来玩。目前23andme单个的价格是99$，购买之后还有10$的回寄预付费，第二个能打8折。目前最大的问题是遗传性人体样本在没有审批之前是不能出境的，当然如果你人肉带几个去美国，基本上没问题。
23andme当前提供的数据，已经基本上满足当前科研领域相关的项目分析，就算你做了全基因组的测序（上w的成本），你能得到有价值的突变信息和23andme用芯片得到的变异信息基本一致。
基于我们提供自己的健康解读服务和社区（和当前国内的商业解读基本一样甚至更好）的情况下，我计划找20个人一起做23andme。价格是1000块钱一份，我帮忙代购和发货去美国，如果样品采样失败，可以全额退款。当然，如果你可以自己买23andme的检测，我们的社区对你也是开放的。:)

有兴趣可以加我qq:820818。
之前我发过一个相关的主题： /t/125794

ryon

2014-11-18 12:04:42 +08:00

@thinkxen 擦，买那么多干啥，自己来一份玩玩就好了。健康数据什么的，自己做了差不多有理解了再给亲朋好友买才好。

bugeye

2014-11-18 19:33:10 +08:00

@ziyuan “另外，国外会不会针对我们种族制作病毒啊，怕怕”

以现在的基因水平和科技水平，可能性是0. 以西方生物伦理学来讲，可能性也是0.美国很多生物实验室为了“牺牲”小鼠还要买专门仪器。这仪器唯一的作用就是使小鼠可以无痛苦的离世。只有这样才能通过伦理学要求（就我所知的大学里，做任何动物实验，都要先经过伦理委员会的评估。从某种意义上讲，医学进步如此之慢也不能排除这方面的原因。）。从经济的角度来说，可能性还是0. 因为这种杀人方法很笨，很蠢，很不可靠，很贵，贵得吓人，不如直接用常规武器或者核武器来得便宜。

事实上目前根本没有可靠的基因办法来分辨人种。目前唯一知道的是人类的长相很可能不是由基因控制的。有一种看法是，长相之类是由“垃圾基因”（非蛋白质编码基因），而非基因决定的。人类对基因的了解大概是小学水平，人类对“垃圾基因”的了解程度基本是0.而垃圾基因在人类的DNA中占到了98%以上的序列。
http://paper.sciencenet.cn/htmlpaper/201312213172952430838.shtm

另外，很有意思的一点，世界上所有人类，除了某些非洲村庄的土著，基因都非常相似。可以认为欧洲人和亚洲人和大部分的非洲人在几万年前都有一个或几个共同祖先。这几个祖先在几万年前从东非高原开始了不可思议的伟大迁移（目前猜测是因为几万年前的某个时间点，“衣服”被发明出来。使得向寒冷地区迁移成为可能。）而考虑到现在人类有70亿之多，，，，人类在生物圈子里其实是爆发户。有一个笑话，任何一个欧洲人和亚洲人的基因差异小于东非某个村庄的任何两个村民。

正是由于只有少数非洲村庄（主要是东非）才有基因多样性，所以科学界主流观点才会认为，人类起源于非洲。理由是基因多样性是由DNA变异累积而成的。而这个主要靠时间才能累积。

目前的汉族，根据一些非常初步，远不完善的基因研究，认为是一到两万年前从东南亚和西藏逐步迁移而来。

ryon

2014-11-19 10:23:45 +08:00

@bugeye 每年多少人去美国。。。想提取个dna还不是容易的事情。:D

xiaojay

2014-11-19 11:17:50 +08:00

@arkilis 悲剧地发现是 ApoE-ε4基因的携带者 ... 郁闷死了

ryon

2014-11-19 12:08:05 +08:00

@xiaojay 多吃点核桃，哈哈。

lzf824446

2014-11-19 12:32:41 +08:00

好玩意儿！买一个！

JoyNeop

2014-11-20 15:35:20 +08:00

@bugeye 说明我们都是 Lilith 的后代……

yangwenli

2014-11-23 22:42:14 +08:00

Sorry to reply this thread with Chinglish, my input method is broken.

@xiaojay

Hi, if memory serves me right, the 23andme doesn't provide phred-scaled quality scores of vcf data. Without quality score and other information/test, nobody can tell you whether you have the high risk variant. According to the document http://snpedia.com/index.php/ApoE-%CE%B54 ,many people develop Alzheimer's who don't have an APOE4 variant.
SO, DON'T PANIC :)

@ryon

Hi, there are lot of tool to understand 23andme vcf data, the only thing we can do is translation.

https://github.com/arrogantrobot/23andme2vcf
http://genomeintelligence.org/?p=745
http://tagteam.harvard.edu/hub_feeds/1981/feed_items/197425

If 23andme doesn't provide the whole information of microarray, any interpretation is nonsense.