Unix （包含 Linux ）的初学者，常常会很困惑，不明白目录结构的含义何在。
举例来说，根目录下面有一个子目录 /bin ，用于存放二进制程序。但是，/usr 子目录下面还有 /usr/bin ，以及 /usr/local/bin ，也用于存放二进制程序；某些系统甚至还有 /opt/bin 。它们有何区别？
长久以来，我也感到很费解，不明白为什么这样设计。像大多数人一样，我只是根据《 Unix 文件系统结构标准》（ Filesystem Hierarchy Standard ），死记硬背不同目录的区别。
昨天，我读到了 Rob Landley 的简短解释，这才恍然大悟，原来 Unix 目录结构是历史造成的。
话说 1969 年， Ken Thompson 和 Dennis Ritchie 在小型机 PDP-7 上发明了 Unix 。 1971 年，他们将主机升级到了 PDP-11 。
当时，他们使用一种叫做 RK05 的储存盘，一盘的容量大约是 1.5MB 。
没过多久，操作系统（根目录）变得越来越大，一块盘已经装不下了。于是，他们加上了第二盘 RK05 ，并且规定第一块盘专门放系统程序，第二块盘专门放用户自己的程序，因此挂载的目录点取名为 /usr 。也就是说，根目录"/"挂载在第一块盘，"/usr"目录挂载在第二块盘。除此之外，两块盘的目录结构完全相同，第一块盘的目录（/bin, /sbin, /lib, /tmp...）都在 /usr 目录下重新出现一次。
后来，第二块盘也满了，他们只好又加了第三盘 RK05 ，挂载的目录点取名为 /home ，并且规定 /usr 用于存放用户的程序，/home 用于存放用户的数据。
从此，这种目录结构就延续了下来。随着硬盘容量越来越大，各个目录的含义进一步得到明确。
/：存放系统程序，也就是 At&t 开发的 Unix 程序。
/usr ：存放 Unix 系统商（比如 IBM 和 HP ）开发的程序。
/usr/local ：存放用户自己安装的程序。
/opt ：在某些系统，用于存放第三方厂商开发的程序，所以取名为 option ，意为"选装"。
来源：
http://www.ruanyifeng.com/blog/2012/02/a_history_of_unix_directory_structure.html 阮一峰的网络日志