是这样的，你想做事情 X，然后你觉得 Y 是做事情 X 的最好方法，所以你发帖来问如何更好地做 Y 。这个现象通常被称为“XY Problem”（参考：
https://coolshell.cn/articles/10804.html ）
换到你的需求来说，我猜就是（可能猜的不准）：
我要在只有 FTP 作为文件管理手段的虚拟主机上，使用 PHP 建设一个网站，用于存储少量的图片。我不希望把每张图片分别存储，因为这样如果需要备份，通过 FTP 下载会很慢。由于我的存储空间有限，所以希望选择空间占用小的方法。
在这个问题下，你觉得使用 sqlite 或者 MySQL 是最理想的选择，但又拿不准哪个占用小，所以来发帖询问这个问题。但显然，无论是 sqlite 还是 MySQL 都不是为这个场景优化的，所以大家对你要做什么表示了疑惑。
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回答你一开始的问题，无论是 sqlite 还是 MySQL 在这种场景下的硬盘资源占用区别不会太大。
不过如果我对你的需求理解没有错的话，我大概会选择存储文件，并且在我的 PHP 后台添加一个功能，点击之后把所有的图片文件打包成一个 zip，再通过 FTP 下载这个 zip 从而规避 FTP 下载大量文件缓慢的问题，同时又避免了把文件存到 sqlite 的风险（数据库错误导致所有图片同时丢失）。