一个科研狗开发的文献管理软件 Paperlib

2022-06-24 04:09:19 +08:00
 SorryChen

我是一个在计算机视觉里蝶泳的科研狗,一个文献管理软件基本是我的刚需。从硕到博这么多年用了各种各样的软件:Papers 、Mendely 、Readcub Papers 、Zotero ,没有一款能让我满意舒服的。


现有的软件

诚然这些软件都是伟大的软件,但是或多或少都有些小问题,比如:

  1. 无法精准的抓取到会议论文的发表情况
  2. 功能做的不咋地,一堆用不上的功能,每年太贵的订阅费 = =
  3. 太丑太丑了,像上个世纪的界面(没错说的就是你 zotero )
  4. ......

我想要的

而我想要的就是一个简简单单的论文管理软件:

  1. 他必须能精准地匹配到会议论文的发表情况。我认为这是一个文献管理软件最重要的功能。其他领域可能看期刊很多,但是像我们领域,大部分论文都是会议论文,我想 NLP 应该跟我们 CV 也差不多。但是会议不像期刊,很多都要很久才有 DOI ,有的甚至没有 DOI ,所以市面上的这些软件,几乎没有一个能很好的精准的匹配会议论文 metadata 的。我想要他精准匹配到是不是发表到 ICLR ICML NIPS ECCV 等会议上。而我不想每次写论文对对着一堆 arxiv publication 一个一个去搜他们发表在哪里的去做校对。
  2. 不需要什么花里胡哨的管理功能,就简单的 Tag ,Folder ,加星,Note 。
  3. 能够方便地进行检索,普通搜索,全文搜索,高级语法搜索,让我在开会时候想跟老师讨论一个论文的时候不需要手忙脚乱的去翻文件夹或者 Google 。。。
  4. 作为计算机行当,虽然 Github 的 star 能够收藏论文的代码仓库,但是并不容易找,更多时候还是去 google 。如果这个软件能帮我自动搜 code repository 然后存在软件里就好了。
  5. 当我准备开始写自己论文的时候,如果有方便的方式一键复制 bibtex 就好了。体验就好像打开 spotlight 输入关键词,直接回车粘贴。
  6. 它有一个简洁的 UI ,清晰的图标,至少看着不是上个世纪的。毕竟颜值就是生产力。

于是,一年多以前,在博士刚开始的时候,我就开始着手自己开发一个,符合上述需求的软件。

跟周围同学分享了一下,大家都觉得挺好用的。之前因为觉得不完美,害怕推广了之后自己没精力维护。经过一年多的打磨,这个软件也伴随我一年多的科研,加两次论文投稿。我已经把大部分功能做到我满意的地步了。所以在这里分享一下,给有同样需要的科研狗们!它就是 Paperlib !


Paperlib

使用简介

亮点

  1. 从 arXiv ,doi.org ,DBLP ,IEEE ,openreview.net ,PaperwithCode ,Google Scholar ,为每一篇论文尽量匹配精确的信息以及代码仓库。
  2. 全文搜索,高级搜索。
  3. 快速导出,一键复制 BibTex 。
  4. 为论文评分,分配标签、文件夹,加星,方便进行分类管理。
  5. 可以云同步数据,macOS win 双平台。
  6. 完全开源。

缺点

  1. 这是按照我一个人的科研习惯打造的,我不确定是否大家用的习惯。
  2. 对比 zotero 这软件,说实话因为自己没怎么用,我可能还不知道它有什么极其强大的功能,也许 Paperlib 这里没有。
  3. 开发者只有我一个人,我无法像大公司那样按时修 Bug 。现在基本是就是我周末没事的时候修一修。(不过自己已经很久没遇到什么恶性 bug 了)
  4. 我的领域是计算机视觉,我不确定其他计算机领域的人,比如 NLP 啊,数据库啊,啥的,能不能准确匹配好论文元数据。如果不准确可以开 Issue ,在软件里我定义了一系列 metadata scrapers ,我们可以一起开发更多的符合计算机领域的。但是目前计划是仅仅覆盖到计算机领域。因为其他领域真的不了解。
  5. Electron 。关于 Electron ,可能大部分人都不喜欢吧。实际上 Paperlib 是有 macOS 原生 swiftUI 版本的 branch 的,完成了一些基础的功能。但是作为一个人开发的软件,平时又要科研,想要维护好 win 和 mac 双平台,实在是太难了。最后我只能转为使用 Electron 。如果有任何喜欢 Paperlib 想接手 swiftUI 版本的同学,我非常欢迎。现在我看了看资源占用实际上也没有很夸张,比 zotero 是小一些的。。。可能因为没那么多乱七八糟的功能吧。。

最后的最后,祝大家科研顺利吧!

网址: https://paperlib.app/en/

Github: https://github.com/GeoffreyChen777/paperlib

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287 条回复
ly879
2023-09-20 22:21:37 +08:00
@ly879 4 )标题、出版社名称能否 格式化(句首字母/单词首字母大写,可参考 https://titlecaseconverter.com/)
ly879
2023-09-20 22:28:45 +08:00
@ly879 5) 选择文件夹/标签后,能否对所属文献进行搜索?目前只能对 all papers 中的搜索; 6 )字段是否支持顺序拖动?如,将年份拖放在标题前面。
SorryChen
2023-09-20 23:32:52 +08:00
@ly879

1 )直接 shift 或者 ctrl 多选,然后拖到左边列表对应条目。
url 支持,使用 markdown 模式的笔记就行了。如下图

https://imageupload.io/ib/deRJkKnGs9UL04S_1695223878.png

2 )重复本来就是会去除的,有的不去除是因为标题和现有的库里的有细微的差距,比如逗号句号之类的。撤稿不知道该去哪里搜寻。

3 )多个附件支持,直接挨个拖就行了。

4 )参考自定义 scraper 部分的 AutoTagger 例子: https://paperlib.app/cn/doc/metadata-scraper/custom-scraper.html#implement-an-auto-tagger

5 )这是个 bug ,在修了。

6 )你是说 TableView 的每列换顺序?可做,但是目前没在做,目前在做 extension 的架构,工程量很大,需要时间。
ly879
2023-09-21 09:00:51 +08:00
@SorryChen 非常感谢回复,想再补充下:对于 1 )说明的是跨文件夹的剪切移动,非复制。目前我试了下,按住 shift 夸问价拖动,实现的效果是复制,源文件夹论文数未变。对于 2 )之前将 WoS 检索结果导入 Zotero ,Zotero 会生成一个已撤稿文件夹,猜测是针对的 WoS 记录里有某些字段说明了。进对于 3 )说明的是,在 tableview 界面有一个标志,可以显示是否有 PDF 原文作为附件。此外,如果有附件了,希望在详情预览窗格,已有附件旁边,显示一个还可添加附件这么意思的图标。
soma13
2023-12-06 19:49:33 +08:00
@luistrong win 平台没找到好的 pdf 阅读器,目前使用 zotero 内置 PDF 加翻译插件
SorryChen
359 天前
@chivier 你好,3.0.0-beta.1 发布了,可在官网下载。

插件系统完成了:

https://paperlib.app/cn/extension-doc/
yqf0215
44 天前
现在的数据库可以做到两台电脑毫秒级同步操作。且自动合并冲突以及离线修改数据库,复网自动同步。这是其他任何方案都做不到的。
@SorryChen 请教一下,mysql 、postgresql 都具备这些功能吗?自动同步? sqlite 具备这些功能吗?

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