nii 是一个 4d 的医学 ct 图像,尺寸为(高,宽,深度,时间)。
我的预期是, 取时间和另外两个维度,转换为一个 mp4 格式的视频。
我的思路,先将 nii 图片转换一个 2 维的数组,然后顺序拼成一个视频。
但是实际, 转换出来的视频画面失真,win11 系统播放器打开画面失真,qq 影音播放器打开提示视频失效。
https://1drv.ms/u/s!Ah4q2HtKB2AWg4NnYXaMslribNVlWw?e=D8ScIs
import os
import cv2
import numpy as np
def nii2imgs_dim(nii, dim) -> list:
"""
将 nii 文件转换为多张图片,返回图片数组,不用中间保存,方便转换为视频
:param nii: nii 对象
:param dim: 要转换的维度
:return: 图片数组
"""
imgs = []
data = nii
for d3i in range(data.shape[3]):
# 读取 3d 文件
d3img = data[:, :, :, d3i]
# 获取 nii 文件的维度
d3img_shape = d3img.shape
# 遍历每一张图片
for d2j in range(d3img_shape[2]):
# 获取第 i 张图片
img = data[:, :, d2j, d3i]
imgs.append(img)
return imgs
def imgs2mp4(img_list, save_path):
"""
将图片数组转换为 mp4
:param img_list: 图片数组
:param save_path: 保存地址
:return: 空
"""
# 判断 save_path 路径是否存在,如果不存在则创建
if not os.path.exists(save_path):
os.makedirs(save_path)
# 图片数组转换为 mp4
img, *imgs = img_list # *imgs 表示剩下的所有元素,img 表示第一个元素,目的是为了获取图片尺寸
print(img.shape)
# img 转换为 float32
img = img.astype(np.float32)
img = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_GRAY2BGR)
height, width, layers = img.shape
video = cv2.VideoWriter(save_path + "video.mp4", cv2.VideoWriter_fourcc(*'mp4v'), 1, (width, height))
video.write(img)
for img in imgs:
img = img.astype(np.float32)
img = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_GRAY2BGR)
video.write(img)
video.release()
img = nib.load(file_path)
data = img.get_fdata()
# nii 转换为多张图片
imgs = nii2imgs_dim(data, 3)
# 将图片数组转换为 mp4
imgs2mp4(imgs, "./tmp/")
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