是这个样子的，launchpad 图标位置信息等存储在一个数据库中，可能出于未知原因，这个数据库不是总是会被初始化，或是 launchpad 程序无法访问它，或者无法更新，再就是该数据库损坏等等，launchpad 程序与数据库无法互通。
首先，确保自己没有安装使用系统优化等的软件，
其次，通过监视这个数据库的变化，来分析问题的所在，具体解说如下：
这个数据库默认地保存在每个用户自己的程序临时文件夹中，这个文件夹的地址有些特殊，可以通过下面的方法看到：
echo $TMPDIR
它看上去是这个样子的：/var/folders/m9/1mc3g1w06v51jy17v0_yt9t40000gn/T/
其实，每个本地帐户都会在 /var/folders/目录下，都有一个自己的子目录，用于应用程序保存自己的运行时数据，比如上面的 m9，还不清楚它下面的子目录“1mc3g1w06v51jy17v0_yt9t40000gn”的含义，但这不妨碍咱们后边的分析。再下面一般有三个子目录，0, T, C 。而我们关心的是 0，在里面有一个目录叫 com.apple.dock.launchpad，launchpad 的数据库就保存在它里面的 db 子目录内。所以全路径就是：/var/folders/m9/1mc3g1w06v51jy17v0_yt9t40000gn/0/com.apple.dock.launchpad/db
这个路径也可以使用下面的目录可以获得：
echo "$(dirname $TMPDIR)/0/com.apple.dock.launchpad/db"
具体如何监测，可以简单监视数据库的修改时间，比如使用下面的命令：
$ ls -l "$(dirname $TMPDIR)/0/com.apple.dock.launchpad/db"
下面是一个例子：
total 8392
-rw-r--r-- 1 me staff 1310720 Aug 3 17:00 db
-rw-r--r-- 1 me staff 32768 Aug 22 20:58 db-shm
-rw-r--r-- 1 me staff 1891112 Aug 24 21:43 db-wal
每次改变 launchpad 中应用的图标位置，文件的时间就会变化。
那么通过这个行为可以观察，它们的时间是否随改动而改变，重启后，是不是也改变了。
如果任何地方出现问题或者可疑，有可能是不同的原因造成。比如，目录错误，有可能是 launchpad 的这个默认路径被未知原因改了；如果无法访问该目录，那么有可能是权限错误；如果每次重启都会改变，有可能是启动时有程序把它改变了；如果是文件时间不变，那么可能它们的联系中断了或者是数据库出错等，等等各种原因。上面只是举例说明，具体原因还要进一步分析。
也可以尝试把这个 com.apple.dock.launchpad 目录转移走 /或者直接删除，重启后，让系统重建一个新的，然后自定义。
对于你的问题的根结，不太好说。既然是刚刚入手的 Mac，有其它程序“从中捣乱”的可能性比较大，其次是数据库损坏。
https://discussionschinese.apple.com/thread/250581574