Fasta Format

Definition / 释义

FASTA 格式：生物信息学中常用的序列文本文件格式，用于存储 DNA、RNA 或蛋白质序列。通常以一行以 > 开头的描述行（header）起始，后面跟随一行或多行的序列字符。

Pronunciation / 发音

/ˈfæstə ˈfɔːrmæt/

Examples / 例句

Please save the gene sequence in FASTA format.
请把这个基因序列保存为 FASTA 格式。

After downloading the database, we converted the reads into FASTA format and then ran a similarity search.
下载数据库后，我们把测序读段转换成 FASTA 格式，然后进行了相似性搜索。

Etymology / 词源

FASTA 最初与一套用于序列相似性搜索的程序相关（20 世纪 80 年代后期在生物信息学中广泛使用）。该名称常被解释为 “FAST-All”（强调“快速”与“通用”），后来“FASTA”也被用来指代这种以 > 作为标题行标记的标准序列文件格式；format 来自拉丁语 forma（形状、形式），引申为“格式/版式”。

Related Words / 相关词

• Sequence
• Genome
• Header
• Annotation
• Alignment
• BLAST
• FASTA
• FASTQ
• GenBank

Literary Works / 文学作品

• Improved tools for biological sequence comparison（Pearson & Lipman，1988）——经典论文中常讨论序列检索与相关数据表示方式（与 FASTA 体系密切相关）。
• Bioinformatics and Functional Genomics（Jonathan Pevsner）——教材/参考书中常出现 “FASTA format” 用于讲解序列数据与分析流程。
• Biological Sequence Analysis（Durbin 等）——在序列分析与比对的语境中频繁提到 FASTA 等序列表示格式。